林业科学研究

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金丝楸优良无性系遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析

马庆国, 王治军, 徐慧敏, 李明昆, 李慧民, 张俊佩, 张建国

2020, 33(5): 145-153. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2020.05.018

关键词: 金丝楸, 遗传多样性, 亲缘关系, AFLP, 指纹图谱

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凉山州核桃坚果表型多样性研究

刘昊, 马庆国, 张继勇, 文明, 宋晓波, 张俊佩, 裴东

2017, 30(5): 771-778. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.05.010

关键词: 核桃, 表型多样性, 凉山, 居群

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云南省核桃品种遗传多样性的FISH-AFLP分析

宁德鲁, 马庆国, 张雨, 王滑, 陆斌, 裴东

2011, 24(2): 189-193.

关键词: 核桃, 品种, 遗传多样性, FISH-AFLP, 聚类分析

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FISH-AFLP分析新疆核桃品种遗传多样性

何健, 马庆国, 雪来提·牙生, 孙东, 孙世国, 裴东

2013, 26(6): 730-735.

关键词: 核桃, 品种, 遗传多样性, FISH-AFLP, 亲缘关系

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核桃基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

周贝贝, 文明, 马庆国, 裴东

2014, 27(6): 741-744.

关键词: 核桃, MSAP, DNA甲基化, 表观遗传学

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基于核桃参考基因组的SSR位点鉴定分析和单态性标记开发

贺君星, 马庆国, 裴东, 张俊佩

2022, 35(6): 89-100. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2022.006.010

关键词: 核桃, 微卫星, 分布规律, 分子标记

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目的为了阐明核桃（Juglans regia L.）（2n=2x=32）全基因组不同染色体上SSR位点数量及其分布特征，开发并验证单态性SSR引物。方法基于核桃品种‘中牧查一’的高质量参考基因组序列图谱，使用MISA软件筛选并分析SSR位点，利用Primer 3.0进行引物设计，通过电子PCR进行引物多态性分析，筛选并合成单态性SSR引物并通过真实PCR实验验证其有效性。结果（1）在全基因组16条染色体上鉴定得到了共计357 629 个SSR位点，分布密度为662.28 SSRs·Mb⁻¹，其中，10～30 bp长度的短序列占95.00%以上，优势重复单元以A/T碱基为主；不同染色体上SSR位点数量差异较大，其中，Chr1染色体上SSR位点数量最多，Chr16染色体上最少，SSR重复单元的数量及种类与染色体长度呈极显著正相关，进一步统计分析获得的644 种稀有SSR单元中六核苷酸重复基元占多数；（2）基于不同染色体上SSR重复单元的类型和数量构建分布矩阵，聚类分析发现，以遗传距离0.075为阈值可将所有染色体分为4组，其中，第4组中成员最多（11条），而第1组中仅有Chr10染色体，总体看，Chr10染色体自成一个主枝，显示其可能经历了较为保守的进化过程；（3）利用SSR 位点侧翼的保守序列设计出SSR引物303 009对，通过电子PCR筛选并随机合成了32对单态性引物进行验证，其中，30对（93.75%）在6 个核桃品种中扩增出了清晰的目标产物，28对（87.50%）的PCR扩增结果与电子PCR评估结果一致。结论本研究鉴定了‘中牧查一’核桃参考基因组不同染色体序列中的SSR位点，发现其数量和重复类型变化较大，且与染色体长度呈极显著正相关，单碱基重复的SSR是最常见的类型。建立了电子PCR与传统方法联用的引物开发流程，同时验证了其有效性，为核桃SSR引物的个性化快速开发提供了有效策略。筛选获得的28对单态性引物可为分子辅助育种中杂交子代“私生检测”等研究提供科学借鉴与参考。

16个早实核桃良种遗传多样性的FISH-AFLP分析

马庆国, 齐静, 裴东

2010, 23(5): 631-636.

关键词: 核桃, 遗传多样性, 亲缘关系, FISH-AFLP, 指纹图谱

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